Биоинформатика (платная)

Комфортный режим обучения: теория в онлайн-курсе и интерактивные вебинары. Возможность обучения из любого места и в любое время. Гибкие форматы практики

Прием на платное обучение по программе открыт

В современном научном мире технологий, особенно с учетом развития методов секвенирования, объем экспериментальных данных стремительно растет, и алгоритмы их анализа постоянно усложняются. Секвенирование являются неотъемлемой частью исследований в области молекулярной биологии, биомедицины и биотехнологии. Для успешного использования результатов секвенирования в своей работе, необходимо применять различные подходы для их анализа, и иметь представление о методах обработки “сырых” данных. Именно поэтому современному исследователю для продуктивной работы просто необходимо уметь самостоятельно создавать программы для генерации таблиц, визуализации результатов, автоматизированной и параллельной обработки данных нескольких экспериментов.

Цель программы – научить исследователей самостоятельно работать с большими объемами данных, получаемых в ходе биолигических экспериментов.

 

Стоимость обучения в 2026/2027 уч. году – 39 000 руб.

Входные требования на 01 сентября 2026 года – практический курс специально разработан для студентов 3-6 курсов направлений подготовки Биоинжинерия и биоинформатика, Биомедицинские системы и технологии, Биотехнология.

Регистрация проходит по кнопке «Зарегистрироваться» через официальный сайт. После получения заявки в течение 1– 2 рабочих дней на электронную почту пришлем более подробную информацию.

Кому подойдет этот курс?

Молекулярнымй биологам, биомедикам и биотехнологам

 

Начинающим исследователям

 

Желающим расширить свои теоретические знания в области секвенирования и получить практические навыки работы с реальными данными

 

Чему вы научитесь?

Обрабатывать и сопоставлять результаты экспериментов

 

Генерировать сводные таблицы и визуализировать результаты

 

Проводить статистический анализ экспрессии генов

 

Обрабатывать данные RNAseq

 

Структура курса

В процессе прохождения данного модуля учащиеся получат знания о операционной системе Linux, научатся создавать скрипты для обработки текстовых данных и программные конвейеры.  Цель модуля – закрепить и расширить навыки работы в Linux и автоматизации задач с помощью bash.

Цель модуля – освоить Python для обработки и анализа биологических данных.

Введение в Python. Анализ данных с Python. Работа с Pandas для обработки табличных данных. Визуализация данных (Matplotlib, Seaborn). Интеграция Python с биоинформатическими инструментами. Информационная безопасность.

В модуле два трека на выбор:

1. Цель 1 трека – Понять принципы выравнивания последовательностей и научиться использовать соответствующие инструменты.

2. Цель 2 трека – Углубить знания о методах выравнивания и их применении в биоинформатике.

Цель – освоить методы реконструкции и анализа филогенетических деревьев.

Методы филогенетического анализа. Интерпретация и визуализация. Анализ топологий деревьев. Визуализация и аннотация (FigTree, iTOL, TreeViewer).

Цель – освоить продвинутые методы сборки геномов и анализа NGS-данных.

Основы RNA-Seq и экспрессии генов. Сравнение платформ: Illumina, PacBio, Oxford Nanopore. Алгоритмы сборки. Оценка качества сборки. Нормализованные единицы выражения экспрессии (RPKM, FPKM, TPM, z-score). Анализ дифференциальной экспрессии. Принципы дифференциальной экспрессии: p-value, log2 fold change, FDR. Инструменты: DESeq2, edgeR. Визуализация: volcano plots, heatmaps (Python/Matplotlib/Seaborn).

Цель – применить полученные знания в реальных биоинформатических проектах.

  • Участие в проектах под руководством специалистов (например, анализ NGS-данных, филогенетический анализ).
  • Разработка пайплайнов для обработки данных.
  • Подготовка отчёта о практике с описанием задач и результатов.

Итоговая аттестация слушателей программы профессиональной переподготовки проводится в виде защиты квалификационных работ

Общая продолжительность курса
256 ч

Кем работают наши выпускники

Биоинформатик – аналитик

Преподаватели программы

Зотова Елизавета Александровна
Зотова Елизавета Александровна
к.э.н., доцент ИБСИБ, педагог дополнительного образования СПбПУ. Координатор курсов по маркетингу
Макашов Андрей Андреевич
Макашов Андрей Андреевич
старший преподаватель ВШБСиТ СПбПУ, специалист в области биоинформатики и эволюционной биологии
Скребенков Евгений Александрович
Скребенков Евгений Александрович
к.ф-м.н.,доцент ВШБСиТ СПбПУ
Васин Андрей Владимирович
Васин Андрей Владимирович
д.б.н., директор Института биотехнических систем и биотехнологий Политехнического университета
Тимошенкова Ирина Алексеевна
Тимошенкова Ирина Алексеевна
к.т.н., доцент Высшей школы биотехнологий и пищевых производств СПбПУ, куратор программы