Биоинформатика

Регистрация закрыта

Комфортный режим обучения: теория в онлайн-курсе и интерактивные вебинары. Возможность обучения из любого места и в любое время. Гибкие форматы практики

В современном научном мире технологий, особенно с учетом развития методов секвенирования, объем экспериментальных данных стремительно растет, и алгоритмы их анализа постоянно усложняются. Секвенирование являются неотъемлемой частью исследований в области молекулярной биологии, биомедицины и биотехнологии. Для успешного использования результатов секвенирования в своей работе, необходимо применять различные подходы для их анализа, и иметь представление о методах обработки “сырых” данных. Именно поэтому современному исследователю для продуктивной работы просто необходимо уметь самостоятельно создавать программы для генерации таблиц, визуализации результатов, автоматизированной и параллельной обработки данных нескольких экспериментов.

Цель программы – научить исследователей самостоятельно работать с большими объемами данных, получаемых в ходе биолигических экспериментов.

Входные требования – практический курс специально разработан для очных и очно-заочных студентов 3-6 курсов направлений подготовки Биоинжинерия и биоинформатика, Биомедицинские системы и технологии, Биотехнология (ИБСИБ СПбПУ).

Кому подойдет этот курс?

Молекулярнымй биологам, биомедикам и биотехнологам

 

Начинающим исследователям

 

Желающим расширить свои теоретические знания в области секвенирования и получить практические навыки работы с реальными данными

 

Чему вы научитесь?

Обрабатывать и сопоставлять результаты экспериментов

 

Генерировать сводные таблицы и визуализировать результаты

 

Проводить статистический анализ экспрессии генов

 

Обрабатывать данные RNAseq

 

Структура курса

Модуль 1. Python для анализа данных (тема 1.1 Введение в язык Python; тема 1.2 Язык Python, основы информационной безопасности; тема 1.3 Язык Python, библиотеки)
72
Модуль 2. Технологии NGS. Работа с данными секвенирования (тема 2.1 Обзор технологий секвенирования; тема 2.2 Linux и анализ данных NGS; тема 2.3 Анализ данных NGS, поиск и аннотация точечных мутаций; тема 2.4 Метагеномика и полногеномное секвенирование, особенности пробоподготовки и анализ данных; тема 2.5 Применение результатов NGS секвенирования в онкологии. Анализ альтернативного сплайсинга; тема 2.6 Анализ экспрессии генов)
108
Практика
60

Общая продолжительность курса
256 ч

Кем работают наши выпускники

Биоинформатик – аналитик

Преподаватели программы

Макашов Андрей Андреевич
Макашов Андрей Андреевич
старший преподаватель ВШБСиТ СПбПУ, специалист в области биоинформатики и эволюционной биологии
Скребенков Евгений Александрович
Скребенков Евгений Александрович
к.ф-м.н.,доцент ВШБСиТ СПбПУ
Регистрация закрыта